Week 10

Prepare your paper for submission.

Цель этой недели – написать английскую аннотацию и обсудить сопутствующие документы.

J: Journal

Список журналов для подачи студенческих работ

Список Олега Бахтеева: Журналы и Конференции

Как реагировать на результаты рецензирования и как писать ответ рецензентам.

General recommendations

Did you write a research paper and ask colleagues for a list of journals to submit? The selection of the proper journal is not about looking through someone's list. It is about your strategy of publication. Do you need it to disseminate, or to report, or to impact? Different goals require different strategies.

A exceptionally reasonable way to choose a journal is to find in your reference papers, which are the most important for your work. The papers that make the background to your results. Submit your paper to a journal where these references were published. 

Before submission analyze the scientific interests of the editor-in-chief and the editorial board. They assign reviewers for your paper. The reviewers are the authors of papers they read and the colleagues they met at conferences. Think about how to fit these agendas. While making a short list of journals of desired impact, check the revision time,  and the acceptance ratio, check if the editor assigns reviewers or you select reviewers by yourself, and check which catalogs this journal is listed. 

Talking of strategies. If your paper is of exceptional impact, just go Science, Nature. If it is a great special-purpose paper of high quality go to one of the top journals in your field (J of Machine Learning, J of AI, EsWA, JMLR). If your paper is in the stream of fashion and you are ready to open-review reject-resubmit game, go to one of those conferences (NIPS, ICLR, ICML). If you have to report your results, look for Special Issues, they appear in impactful journals and go. They have a reasonable acceptance rate and processing time. The least of that is plenty of low-impact journals and most of them have a careful reviewing process.

Do not forget arXiv as a tool to fix and disseminate ideas, but remember, it is not a scientific journal to publish. And please do not publish in predator houses.

Do not use lists of journals that are made by some random guy, they are useless. List the journal your colleagues publish, if you want to get brief advice and experience. However here are the lists.

Select your journal

Для чтения: Как публиковаться в выскоимпактных журналах? Цитата: "исследователи, успешно публикующиеся в журналах с высоким импакт-фактором, пишут свои рукописи на трех уровнях: первый — это резюме, доступное широкому кругу читателей и содержащее основные выводы, второй — это базовый документ с основными результатами исследований для тех, кто хочет получить более подробную информацию, как именно был получен вышеозначенный результат, и третий — это приложение со всем необходимым для воспроизведения результата. Вот формат, который ждут от вас журналы вроде Science и Nature."

Как найти журнал

• Ищем, кто публикуется по нашей теме, его базовые работы. На кого мы ссылаемся в работе.
• Смотрим в каком журнале эти работы.
• Смотрим какие еще работы по этой теме опубликовал этот журнал.
• Связываем обзор литературы с этими работами.
• Подаем туда.

Для пользователей каталога WoK

• Ищем наиболее близкую работу
• Строим дерево цитирования вперед и назад во времени
• Теоретически ссылки должны замыкаться, но сейчас это происходит все реже

Как подать статью в русский журнал

Для справки: индекс цитирования, инструменты

Журналы ВАК

Список зарубежных журналов ВАК по тематике курса

• Журнал вычислительной математики и математической физики[1]
• Автоматизация и современные технологии[2]
• Проблемы машиностроения
• Автоматика, связь, информатика
• Интеллектуальные системы[3] (Мехмат МГУ, МАТИС)
• Информатика и ее применения[4]
• Информационные технологии[5]
• Информационные технологии и вычислительные системы[6]
• Теория вероятностей и ее применения[7] (Журнал SIAM)
• Обозрение прикладной и промышленной математики[8] (Сайт ТВП)
• Проблемы прогнозирования[9]
• Заводская лаборатория[10]
• Математическая биология и биоинформатика[11]

Замечание. Название журнала иногда слабо связано с его тематикой.

Подаем статью в редакцию

Статья написана, нужно:

• прочитать ее громко вслух,
• дать почитать рецензенту, получить критические замечания, доработать.

Затем переходим к формированию пакета документов.

1. Делаем перевод названия статьи, аннотации, ключевых слов, на английский язык, внимательно вычитываем. Вставляем этот блок (название, авторы, аннотация, ключевые слова) в конец статьи.
2. Находим подходящий УДК, ставим в первую строку, до заголовка статьи.
3. Собираем файл tex>pdf, проверяем название: «Author2011Title.pdf» (фамилия автора и первое или ключевое слово названия статьи).
4. Читаем раздел «Авторам, требования к оформлению статей» на сайте журнала, выполняем эти требования.
   1. Если журнал принимает статьи TeX, то посылаем файлы .pdf, .tex и .eps. Рисунки .eps должны компилироваться из одной папки со статьей, из названия должны иметь вид «Author2011Title_Fig1.eps». Если журнал предлагает стилевой файл (.sty, .cls) компилируем с ним, если не предлагаем, пользуемся по умолчанию стилем atricle.
   2. Если журнал принимает статьи MS-Word, то пользуемся конвертором LaTeX-to-Word; то, что он не сделал, дорабатываем руками. Замечание: рисунки для MS-Word лучше всего записывать не в формате .eps, а в формате .emf.
5. Делаем файл «Сведения_об_авторах.doc‎», вписываем себя (и соавторов, если есть).

Сведения об авторах

Фамилия Имя Отчество
студент
Московский физико-технический институт
119991, ГСП-1, Москва, Вавилова д. 42, оф. 151
Тел. служебный: 8 (495) 135-4163 
Факс: 8 (495) 137-2848 
E-mail: Name.Surname@mipt.ru

Пишем письмо следующего вида и отсылаем в журнал письмо и файл-статью (файлы, если это TeX) и файл-сведения по адресу, указанному журналом.

Тема: Новая статья [Автор И.О. Название]
 
Уважаемый [Имя Отчество главного редактора журнала]!

Прошу Вас принять к рассмотрению для публикации в журнале "[Название журнала]"
статью "[Название статьи]". Статья посвящена проблеме [выбора регрессионных 
моделей] и ранее нигде не публиковалась. 

Прилагаю статью с аннотациями на русском и английском языках, а также сведения об авторах.

С уважением,
[Имя Отчество Фамилия]
[Организация]
[телефоны для связи]

И. О. Автор, студ., Московский физико-технический институт
[Название статьи]
[Текст аннотации на русском языке]
Ключевые слова: [пять слов или словосочетаний через запятую].

N. M. Surname, Moscow Institute of Physics and Technology
[Feature selection in autoregression forecasting]
[The abstract itself]
Keywords: [keywords].

Замечание. Процесс рецензирования в некоторых журналах иногда занимает более года. После возможно отклонение статьи по разным причинам. Тем не менее, подавать одну и ту же статью сразу в несколько журналов не принято.

Работа с рецензентами

Через некоторое время (одна-две недели) автору приходит сообщение, что статья получена редколлегией и направлена на рецензирование. Если сообщение не приходит, то нужно вежливо написать или позвонить секретарю (или ответственному редактору).

Через несколько месяцев (максимум — полгода) должна прийти рецензия от одного или нескольких рецензентов. Возможны варианты.

1. Статья принята при условии доработки с учетом замечаний рецензентов — прекрасно. Это означает, что статью внимательно прочитали и ее можно улучшить. Исправляем статью и составляем отчет о проделанной работе, который вместе со статьей отправляем в журнал. См. пример отчета.
2. Статья будет повторно рассмотрена после доработки — хорошо, бывают такие строгие журналы. Делаем как в пункте выше.
3. Статья принята без доработки — нормально, но к таким журналам нужно относиться осторожно, возможно, редколлегия статью детально не читала. Если это так, больше там не публикуемся.
4. Статья отвергнута по каким-то причинам — скорее всего ошибка автора статьи: статья не соответствует тематике или в редколлегии не нашлось специалиста. (А еще и так бывает: статья написана плохо, см. предпоследний пункт).
5. Статья требует существенной переработки — плохо;
   1. если с детальным указанием что нужно делать, то можно попытаться исправить как в п. 1,
   2. если без указания что нужно делать, то считаем, что редколлегия отвергла статью в вежливой форме (хотя нужно было отвергнуть явно),
   3. статья действительно плохо написана, советуемся с коллегами/научными руководителями, они вам скажут, что думают о вашей работе.
6. Ответа из редколлегии нет — плохо, статью либо потеряли, либо работа редколлегии плохо организована, добиваемся ответа.

Работа с редактором

Перед публикацией статьи может прийти письмо с предложением встретиться с редактором журнала для технической правки текста. Рекомендуется пойти, познакомиться с редактором и поработать вместе над статьей. Это занимает два-четыре часа. Результат — статья, приведенная в соответствие со стандартами и с нормами русского языка. Вариант: редактор присылает технические правки в файле PDF, автор их принимает или отвергает.

• Совет консультантам. Желательно править статью вместе при встрече. Пример общепринятой рукописной редакторской правки тут, PDF.

Как подать статью в международный журнал

• Scimago Journal & Country Rank Q1,Q2,...

Памятка переводчику

1. Проще – лучше.
2. Предложение состоит из подлежащего и сказуемого. И дополнения.
3. Прочего следует избегать. Ищите подлежащее. Предложение состоит из трех-пяти слов.
4. Каждое существительное – точный термин.
5. Существительное имеет свой точный глагол – сказуемое.
6. Глагол имеет точный предлог перед дополнением.
7. Точный – это значит, что его надо найти в образцах или в словарях.
8. Словарный состав должен быть минимален.
9. Пассива не существует.
10. Актив для повествования, императив для описания алгоритмов. Роль артиклей значима. Их разнообразие велико.
11. Не сочиняйте ни слова, ни конструкции. Не придумывайте текст. Ищите его у англичан. Англичанами являются: 1) Стивен Вольфрам, 2) Кристофер Бишоп, 3) Дэвид Маккай.
12. Копируйте из учебников.

• Упражнение. Включите "Auto-description" при просмотре фильмов. Обратите внимание на построение предложений и глаголы. Проанализируйте использование предлогов.

TODO на что нужно обратить внимание при подаче статью в журнал с высоким импакт-фактором.

Что сделать

• Найти журналы опубликовавшие статьи, на которые нужно сослаться. В работе, подаваемой в журнал, желательно иметь 3-5 ссылок на его ранние номера (1-4-летней давности). В идеале нужно найти журнал, содержащий статьи, в которых предлагается "почти то же самое", что и в подаваемой статье. Желательно иметь список из 3-7 журналов. (Предпочтение научного руководителя - IF 2.0-4.0, но можно и меньше).
• Журналы искать в коллекциях
  • Elsevier
  • Taylor&Francis
  • Springer
  • Hindawi Publishing Corporation
  • Других (пополнить)
• Найденные журналы должны быть в списках ВАК, то есть «включены в хотя бы одну из систем цитирования Web of Science, Scopus, Web of Knowledge, [], Mathematics, [], Springer»[12].
  • Вставить ссылку (платный вход во все перечисленные системы?[13])
  • Возможно, похожа база ScienceDirect (там ссылка на SciVerse, они что, все слились в одну систему?).
• Найти статьи, опубликованные за последние восемь лет, на которые опирается подаваемая статья. Желательно иметь список из 20 статей.
• Статьи искать по всему интернету, включая платные коллекции. Желательно ссылаться на статьи из журналов списка SicenceDirect/WebOfKnowledge.

Список журналов

• Journal of Statistical Planning and Inference IF=0.691
• IEEE PAMI IF=?
• JMLR IF=2.94.
• Журналы ВАК по тематике ресурса

Коллекции и наукометрические системы

• ScienceDirect
• Thomson Reuters
• SciVerse
• Publish or Perish
• Microsoft Academic Search
• Science Citation Index на Википедии

Ликбез от Elsevier

• Preparing your Manuscript
• Using Proper Manuscript Language
• Structuring an Article
• Edit checklist
• Article highlights
• Article of the future

Правила оформления научных работ

• Elsevier’s guide to publication
• A better way to format your document
• Author Artwork Instructions
• The elsarticle LaTeX document class
• Russian: \usepackage[cp1251]{inputenc} \usepackage[russian]{babel}
• Ключевые слова по MSC-кодам[14]
• Коммутативные диаграммы в LaTeX, справочник
• Аркадий Мильчин и Людмила Чельцова, 2018. Справочник издателя и автора (Редакционно-издательское оформление издания). Издательство Студии Артемия Лебедева

Совет. Прежде, чем показать свою работу, проверьте орфографию и пунктуацию. Формулы (в том числе и выключенные) являются частью системы пунктуации. Сверяйтесь с хорошими образцами!

Список обозначений

• Численные методы обучения по прецедентам (практика, В.В. Стрижов)/Рекомендуемые обозначения
• Notation in probability and statistics
• List of logic symbols
• Mathematical notation общие сведения
• Стандарт ISO 31-11 из группы ISO 80000; по нашей специальности IEC 80000-13:2008 (Quantities and units -- Part 13: Information science and technology)
• Abuse of notation
• Greek letters used in mathematics
• Latin letters used in mathematics
• List of mathematical symbols
• Typographical conventions in mathematical formulae
• Blackletter

Руководства по ТеХнической части

• Custom Export для JabRef
• Для конвертации LaTeX-исходников в формат MS Word использовать GrindEQ (первые 10 запусков бесплатны)

Советы

"Можно ли невозбранно цитировать материалы Википедии" "Как избежать плагиата"

English abstract

• Check the author's guideline if the alternative Abstract and References are necessary.

Conclusion and future research

1. Check if the conclusion delivers your message and main result comprehensively.
2. Put plans for the future research in the last paragraph of this section.

Graphical abstract

1. See homework for 3rd slide: you have done it!
2. Recommendations from
   1. Elsevier
   2. Springer

Highlights

1. See homework from Stepik: you have done it!
2. Recommendations from
   1. Elsevier
   2. Springer

Affiliations and acknowledgements

1. Check the authors' names and affiliations.
2. Put all necessary acknowledgements and thanks to the proper section of to the footnote.

Letter to the editor

Dear Editor,
We hereby submit a manuscript entitled «Comprehensive study of feature selection methods» by  [Authors] to be considered for publication as an original article in [Journal]. This paper performs comprehensive analysis of the feature selection methods in case of multicollinearity in data set, proposes using quadratic programming feature selection method in case of multicollinearity and demonstrates performance of the proposed approach compared with other feature selection methods. We believe these findings will be of interest to the readers of your journal. We declare that this manuscript is original, has not been published before and is not currently being considered for publication elsewhere. We wish to confirm that there are no known conflicts of interest associated with this publication and there has been no significant financial support for this work that could have influenced its outcome. The manuscript has been read and approved by all named authors. We hope you find our manuscript suitable for publication and look forward to hearing from you.
Sincerely,

Resources

• Video for week 10.
• Slides for week 10.